La Commissione Europea ha elaborato il documento di riferimento EMAS per il settore agricoltura.

Tale documento include la migliore pratica di gestione ambientale, indicatori di prestazione ambientale, ed esempi di eccellenza. Le organizzazioni del settore agricoltura, registrate o in procinto di registrarsi EMAS, devono tenere conto di tale documento quando sviluppano i rispettivi sistemi di gestione ambientale e valutano le rispettive prestazioni ambientali nella dichiarazione ambientale.